Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrs1Q9CYH6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrs1Q9CYH6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrs1Q9CYH6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrs1Q9CYH6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrs1Q9CYH6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms