Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms