Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChtopQ9CY57 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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