Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CWU4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CWU4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CWU4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CWU4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CWU4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CWU4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CWU4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms