Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Cdca4Q9CWM2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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