Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms