Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccer1Q9CQL2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccer1Q9CQL2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccer1Q9CQL2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccer1Q9CQL2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccer1Q9CQL2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccer1Q9CQL2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccer1Q9CQL2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccer1Q9CQL2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccer1Q9CQL2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccer1Q9CQL2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccer1Q9CQL2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccer1Q9CQL2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms