Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH3

Ndufb5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb5Q9CQH3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb5Q9CQH3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb5Q9CQH3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb5Q9CQH3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb5Q9CQH3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb5Q9CQH3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb5Q9CQH3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ndufb5Q9CQH3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ndufb5Q9CQH3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ndufb5Q9CQH3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ndufb5Q9CQH3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufb5Q9CQH3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms