Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQF4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQF4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CQF4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQF4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQF4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQF4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQF4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms