Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQC3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQC3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQC3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQC3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQC3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms