Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms