Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rpl17Q9CPR4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms