Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn6Q99PL6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ubxn6Q99PL6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ubxn6Q99PL6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ubxn6Q99PL6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ubxn6Q99PL6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ubxn6Q99PL6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ubxn6Q99PL6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ubxn6Q99PL6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ubxn6Q99PL6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ubxn6Q99PL6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn6Q99PL6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn6Q99PL6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn6Q99PL6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn6Q99PL6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn6Q99PL6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn6Q99PL6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn6Q99PL6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn6Q99PL6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn6Q99PL6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn6Q99PL6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn6Q99PL6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn6Q99PL6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn6Q99PL6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn6Q99PL6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn6Q99PL6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn6Q99PL6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn6Q99PL6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn6Q99PL6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn6Q99PL6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms