Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b1Q99NB9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms