Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atoh8Q99NA2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms