Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf17Q99MV7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms