Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS8

Tpgs1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs1Q99MS8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpgs1Q99MS8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpgs1Q99MS8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpgs1Q99MS8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpgs1Q99MS8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpgs1Q99MS8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpgs1Q99MS8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpgs1Q99MS8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpgs1Q99MS8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpgs1Q99MS8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpgs1Q99MS8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpgs1Q99MS8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpgs1Q99MS8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpgs1Q99MS8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpgs1Q99MS8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpgs1Q99MS8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpgs1Q99MS8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpgs1Q99MS8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpgs1Q99MS8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpgs1Q99MS8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpgs1Q99MS8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpgs1Q99MS8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpgs1Q99MS8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpgs1Q99MS8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs1Q99MS8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms