Protein–RNA interactions for Protein: Q99M28

Rnps1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnps1Q99M28 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnps1Q99M28 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms