Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms