Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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Sh3bp5lQ99LH9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms