Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q99KU6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q99KU6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q99KU6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q99KU6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q99KU6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q99KU6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q99KU6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q99KU6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q99KU6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q99KU6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q99KU6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q99KU6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q99KU6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q99KU6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q99KU6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q99KU6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q99KU6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q99KU6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q99KU6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q99KU6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q99KU6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q99KU6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q99KU6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q99KU6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q99KU6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q99KU6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q99KU6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q99KU6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q99KU6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q99KU6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q99KU6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q99KU6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q99KU6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q99KU6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q99KU6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q99KU6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q99KU6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q99KU6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q99KU6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q99KU6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q99KU6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q99KU6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q99KU6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q99KU6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q99KU6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q99KU6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q99KU6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q99KU6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q99KU6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q99KU6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q99KU6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q99KU6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q99KU6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q99KU6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q99KU6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q99KU6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q99KU6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q99KU6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q99KU6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q99KU6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q99KU6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q99KU6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q99KU6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q99KU6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q99KU6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q99KU6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q99KU6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q99KU6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q99KU6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q99KU6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q99KU6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q99KU6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q99KU6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q99KU6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q99KU6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q99KU6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q99KU6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q99KU6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q99KU6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q99KU6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q99KU6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q99KU6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q99KU6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q99KU6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q99KU6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q99KU6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q99KU6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q99KU6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q99KU6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q99KU6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q99KU6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q99KU6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q99KU6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q99KU6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q99KU6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q99KU6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q99KU6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q99KU6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q99KU6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms