Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dok4Q99KE3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms