Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms