Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kdelr1Q99JH8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kdelr1Q99JH8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kdelr1Q99JH8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kdelr1Q99JH8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kdelr1Q99JH8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kdelr1Q99JH8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kdelr1Q99JH8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kdelr1Q99JH8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kdelr1Q99JH8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms