Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf112Q96DY5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms