Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms