Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms