Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpm2Q91YD4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpm2Q91YD4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpm2Q91YD4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpm2Q91YD4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpm2Q91YD4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpm2Q91YD4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpm2Q91YD4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpm2Q91YD4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpm2Q91YD4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpm2Q91YD4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpm2Q91YD4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpm2Q91YD4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpm2Q91YD4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpm2Q91YD4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpm2Q91YD4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpm2Q91YD4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpm2Q91YD4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpm2Q91YD4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpm2Q91YD4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpm2Q91YD4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpm2Q91YD4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms