Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY7

Pcdhga12, Protocadherin gamma A12, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga12Q91XY7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdhga12Q91XY7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms