Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms