Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms