Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDN4

Ccdc92, Coiled-coil domain-containing protein 92, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92Q8VDN4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms