Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCK3

Tubg2, Tubulin gamma-2 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg2Q8VCK3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms