Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4Y8

Rttn, Rotatin, mousemouse

Predictions only

Length 2,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RttnQ8R4Y8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RttnQ8R4Y8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms