Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms