Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hecw1Q8K4P8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hecw1Q8K4P8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hecw1Q8K4P8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hecw1Q8K4P8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hecw1Q8K4P8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hecw1Q8K4P8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hecw1Q8K4P8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms