Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms