Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms