Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf13Q8K2W6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf13Q8K2W6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf13Q8K2W6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf13Q8K2W6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf13Q8K2W6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf13Q8K2W6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phf13Q8K2W6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phf13Q8K2W6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phf13Q8K2W6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phf13Q8K2W6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phf13Q8K2W6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phf13Q8K2W6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Phf13Q8K2W6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf13Q8K2W6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms