Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Fcho1Q8K285 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Fcho1Q8K285 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Fcho1Q8K285 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Fcho1Q8K285 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Fcho1Q8K285 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcho1Q8K285 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms