Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0V4

Cnot3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot3Q8K0V4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot3Q8K0V4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot3Q8K0V4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot3Q8K0V4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot3Q8K0V4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot3Q8K0V4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms