Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms