Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDS7

Uncharacterized protein C21orf140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CDS7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8CDS7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8CDS7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8CDS7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8CDS7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8CDS7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8CDS7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8CDS7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8CDS7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8CDS7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8CDS7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8CDS7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms