Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms