Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrip1Q8CBD1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms