Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7D2

Crbn, Protein cereblon, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrbnQ8C7D2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CrbnQ8C7D2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CrbnQ8C7D2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms