Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J6

Sowahc, Ankyrin repeat domain-containing protein SOWAHC, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SowahcQ8C0J6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SowahcQ8C0J6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SowahcQ8C0J6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SowahcQ8C0J6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SowahcQ8C0J6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SowahcQ8C0J6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SowahcQ8C0J6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SowahcQ8C0J6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SowahcQ8C0J6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SowahcQ8C0J6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SowahcQ8C0J6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SowahcQ8C0J6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SowahcQ8C0J6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SowahcQ8C0J6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SowahcQ8C0J6 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SowahcQ8C0J6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SowahcQ8C0J6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SowahcQ8C0J6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms