Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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FarsaQ8C0C7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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FarsaQ8C0C7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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FarsaQ8C0C7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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FarsaQ8C0C7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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FarsaQ8C0C7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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