Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccser1Q8C0C4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccser1Q8C0C4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccser1Q8C0C4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccser1Q8C0C4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccser1Q8C0C4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccser1Q8C0C4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccser1Q8C0C4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccser1Q8C0C4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccser1Q8C0C4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccser1Q8C0C4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccser1Q8C0C4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccser1Q8C0C4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccser1Q8C0C4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccser1Q8C0C4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccser1Q8C0C4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccser1Q8C0C4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccser1Q8C0C4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccser1Q8C0C4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccser1Q8C0C4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccser1Q8C0C4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccser1Q8C0C4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccser1Q8C0C4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccser1Q8C0C4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccser1Q8C0C4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccser1Q8C0C4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccser1Q8C0C4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccser1Q8C0C4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccser1Q8C0C4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccser1Q8C0C4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccser1Q8C0C4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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