Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Snx16Q8C080 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx16Q8C080 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx16Q8C080 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx16Q8C080 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx16Q8C080 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx16Q8C080 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx16Q8C080 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx16Q8C080 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx16Q8C080 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx16Q8C080 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx16Q8C080 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx16Q8C080 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx16Q8C080 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx16Q8C080 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx16Q8C080 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx16Q8C080 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx16Q8C080 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx16Q8C080 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx16Q8C080 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx16Q8C080 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx16Q8C080 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx16Q8C080 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx16Q8C080 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx16Q8C080 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Snx16Q8C080 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx16Q8C080 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx16Q8C080 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Snx16Q8C080 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Snx16Q8C080 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Snx16Q8C080 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Snx16Q8C080 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Snx16Q8C080 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms